合同协议书与合同条款的区别在于，协议书更注重整体框架和双方意向，合同条款则细化具体执行细节。依据《民法典》相关规定，合同内容应详细包括双方信息、标的、数量、质量等，而协议书可能概括性更强。不及时明确具体条款可能导致执行过程中产生纠纷，影响合同履行。
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处理合同协议书与合同条款的区别，常见方式有：1. 明确协议书为框架性文件，合同条款为具体执行细节；2. 在协议书基础上，签订详细合同。选择哪种方式取决于双方合作的复杂度和需要明确的细节程度。
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合同协议书是框架，合同条款是细节。1. 协议书确定合作意向、主要内容和双方责任；2. 合同条款则明确具体执行标准、期限、违约责任等；3. 根据实际情况，可先在协议书中达成共识，再制定详细合同条款。