补充协议中完全可以变更合同主体。只要变更行为符合《民法典》规定的要素，即行为人具备民事行为能力、意思表示真实，且不违反法律法规和公序良俗，那么变更后的合同依然具有法律效力。主体变更不会影响到已经依法订立的补充协议的法律效力。
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关于补充协议中的合同主体变更，处理方式需确保变更符合法律要求。可以通过合同转让或者签订新的协议来实现主体的变更。在操作过程中，应充分考虑合同的性质、当事人的约定以及法律规定，以保证变更后的合同仍然具有法律效力。
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可以通过一定途径变更合同主体。具体的操作方式包括：首先，双方经过协商一致，明确变更内容并签订补充协议；其次，重新签订新的合同，以替代原合同，并在新合同中注明主体的变更情况。无论采取哪种方式，都必须确保变更不违反相关的法律法规，以保障双方的权益。