如果妻子后来知道了丈夫的借款行为，但她并没有明确表示同意，这通常不会改变债务的归属。根据《民法典》第一千零六十四条，夫妻共同债务需要双方共同签名或一方事后追认等共同意思表示。妻子仅仅是知情，并未作出任何形式的追认，因此这笔债务仍可能不被视为夫妻共同债务。法律依据为《民法典》第一千零六十四条关于夫妻共同债务认定的规定。
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如果妻子在事后通过行动表明了对借款的默认接受，如帮助还款，这可能被视为她对借款的追认。在此情况下，债务可能被视为夫妻共同债务。具体操作包括：收集妻子帮助还款的证据，如转账记录、还款凭证等，以证明妻子的追认行为。
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从法律角度看，妻子可以通过以下方式保护自己不受未知债务的影响：一是确保对丈夫的财务活动保持一定了解；二是在涉及共同财产的重大决策上，要求共同参与和签名；三是如遇未知债务，及时收集证据，如通讯记录、财务凭证等，以证明自己对债务的不知情和未参与。这些措施有助于在法律上维护自己的权益。